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新冠病毒是否已經發生突變?如何突變?這是目前學界研究的焦點之一。中國科研團隊最新發現顯示:新冠病毒已於近期產生了149個突變點,並演化出了兩個亞型,分別是L亞型和S亞型。研究發現,在地域分布及人群中的比例,這兩個亞型表現出了很大測差異。其中S型是相對更古老的版本,而L亞型更具侵略性傳染力更強。對不同亞型的深入了解,將有助於新冠肺炎的差異化的治療和防控。
以上研究來自中國科學院主辦的《國家科學評論》(National Science Review)於3月3日發表的論文《關於SARS-CoV-2的起源和持續進化》(On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2)。
論文通訊作者為陸劍研究員(北京大學生命科學學院生物信息中心)、崔傑研究員(中國科學院上海巴斯德研究所)。
論文通過對目前為止最大規模的103個新冠病毒全基因組分子進化分析,發現病毒株已發生了149個突變點,而且多數是近期產生的。該研究揭示:新冠病毒已經演化出L和S兩個亞型。其中101個屬於這兩個亞型。從占比上看,L亞型更為普遍達到70%,S亞型占30%。
論文作者認為,根據新型冠狀病毒的演變方式推測,L亞型和S亞型的傳播能力、致病嚴重程度或許存在較大區別。
論文稱,兩個亞型的區別在於病毒RNA基因組的第28144位點,L亞型是T堿基(對應亮氨酸,Leu),S亞型是C堿基(對應絲氨酸,Ser)。通過與其他冠狀病毒比較,作者發現S型新冠病毒與蝙蝠來源的冠狀病毒在進化樹上更接近,從而得出S型相對更古老的結論。
L亞型在武漢爆發的早期階段更為普遍,而L亞型的發生頻率在2020年1月初後有所下降。作者認為,人為干預可能對L亞型施加了更大的選擇性壓力,如果沒有這些干預,L亞型可能更具侵略性和擴散得更快速。另一方面,由於選擇壓力相對較弱,在進化上較老且攻擊性較小的S型可能在相對頻率上有所增加。這些發現意味著,目前迫切需要結合基因組數據、流行病學數據和2019年冠狀病毒病患者臨床癥狀圖表記錄,進行進一步的全面研究。
另外,值得注意的是,這103個樣本顯示,大部分患者只感染了L亞型或S亞型中的一個。但其中一位近期有過武漢旅行史的美國患者分離出的病毒株,這兩個位點卻均呈現了C和T的混合現象,也就是說,很有可能這位患者同時感染了L型和S型新冠病毒。不過,作者表示目前還無法排除新突變型的可能性。
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